商务服务功能区
 
       包括中央商务区、口岸服务区、国际居住区。利用滨马骝洲水道和十字门水道、邻小横琴山的地理特征,提供现代化和标志性的商务区、交通枢纽和口岸建筑,发展中高端居住社区,打造横琴新区的门户。强化商务办公、服务、会展为核心功能的同时,沿马骝洲水道引入滨水休闲生活带及绿色开敞空间系统,建设融商业、休闲、游憩、游艇停泊、水上运动于一体的场所,提升旅游休闲、文化娱乐等功能。
 
科教研发功能区
 
       即天沐河两岸地区,包括教学区、综合服务区、文化创意区、科技研发区、高新技术产业区。以天沐河为核心,结合两侧行政、教育、商业、文化、体育、科研、医疗、工业、仓储、居住等用地功能,创造一条串联一系列亲水空间、可连续通行和体验的天沐河生态景观廊道。充分利用横琴“两山夹一谷,一水贯东西”的独特自然景观资源优势,引入“楔形生态廊道”,加强大小横琴山的空间秩序,建构完善的自然生态景观格局,形成“两山一水、群组相生、山水交融”的布局结构。天沐河汇集两山溪流,形成若干景观湖面。从西至东,湿地、河道、湖泊、水网,构成多样的水体景观,两岸滨水建筑交相辉映,增加滨水空间活力。
 
休闲旅游功能区
 
       包括生态景观区和休闲度假区,主要由大横琴山、长隆国际旅游度假区、红旗旅游文化村组成,强调建筑与自然环境的融合和保护自然生态环境。结合大横琴山的地形特征,以建设具有国际影响的旅游、休闲胜地为目标,重点发展休闲度假、商业会议度假、主题游乐等功能,打造“依青山华翠,凭银滩椰风,观碧海沧澜”的休闲度假区。