20世纪80年代以来，香港、澳门与内地之间的运输通道、特别是香港与广东省珠江三角洲东岸地区的陆路运输通道建设取得了明显进展，有力地保障和推进了香港与珠江三角洲地区经济的互动发展，但是香港与珠江西岸的交通联系却一直比较薄弱。1997年亚洲金融危机后，香港特区政府为振兴香港经济，寻找新的经济增长点，认为有必要尽快建设连接香港、澳门和珠海的跨海陆路通道，以充分发挥香港、澳门的优势，并于2002年向中央政府提出了修建港珠澳大桥的建议。
2003年 2004年 2005年 2006年 2007年 2008年 2009年 2010年 2011年 2012年
2003年
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7月
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国家发展和改革委员会（“国家发改委”）与香港特区政府共同委托完成了《香港与珠江西岸交通联系研究》，研究结果表明港珠澳大桥具有重大的政治及经济意义，是最具迫切性和必要性的。
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在北京召开的第四次内地与香港大型基础设施协作会议上，粤港澳及珠海市代表确认了港珠澳大桥的必要性及迫切性，并一致认为，港珠澳大桥具有特别的政治、经济意义，可达至多项宏观社会经济效益，项目应及早进行。
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8月
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4日，国务院正式批准三地政府开展港珠澳大桥前期工作，并同意粤、港、澳三地成立“港珠澳大桥前期工作协调小组”，全面开展各项前期工作。
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29日，由香港特区政府、广东省政府及澳门特区政府代表组成的港珠澳大桥前期工作协调小组第一次会议在广州召开，与会代表就港珠澳大桥前期各项工作交换意见，并进行了建设性讨论。
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10月
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12日，港珠澳大桥前期工作协调小组在珠海举行了第二次会议，各方就有关事宜做了进一步研究，并部署了下一步成立办公室的工作。
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2004年
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2月
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23日，港珠澳大桥前期工作协调小组与中交公路规划设计院有限公司正式签署“有关委托中交公路规划设计院进行港珠澳大桥工程可行性研究备忘录”。
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3月
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港珠澳大桥前期工作协调小组办公室成立，全面启动港珠澳大桥各项建设前期工作
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7月
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22日，港、粤、澳三方代表为设在广州的协调小组办公室正式揭匾。同日，港珠澳大桥前期工作协调小组召开第三次会议，会上听取了公规院关于大桥五个线位方案的初步研究成果，并对大屿山锚地油轮作业区问题、口岸管理模式等问题进行了讨论。会后，公规院综合各方意见，提出散石湾北线、散石湾南线和极南线三类共六个桥位方案，并对其展开进一步研究。
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12月
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5日，《港珠澳大桥工程可行性研究报告》（送审稿）正式提交协调小组。
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17日，港珠澳大桥前期工作协调小组第四次会议于广州召开，会议就大桥工程可行性研究结论、协调通航标准、白海豚自然保护区、港珠澳大桥投融资方案及三地框架协议等问题进行了讨论，提出了需要进一步研究的问题及新增论证专题。
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2005年
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3月
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协调小组委托中国水产科学研究院南海水产研究所开展大桥工程对中华白海豚影响专题研究工作。
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4月
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1日-2日，国家发改委主持召开了港珠澳大桥桥位技术方案论证会，确定了大桥东岸以香港散石湾为登陆点，西岸以拱北/明珠为登陆点，推荐采用北线桥隧组合方案。
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2日，港珠澳大桥前期工作协调小组第五次会议在珠海召开，粤港澳三方政府同意专家组推荐意见，确定大桥东岸登陆点为大屿山散石湾，西岸澳门登陆点为明珠点，珠海登陆点为拱北，优先考虑采用北线散石湾～拱北/明珠桥隧组合方案。
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6月
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1日-5日，国家发改委和国务院港澳办组成港珠澳大桥口岸专题研究小组赴深圳和珠海进行调研。
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10月
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12日，港珠澳大桥获得广东省国土资源厅关于珠海侧接线工程地质灾害评估工作和用地范围内矿产压覆情况审查的政府批文。
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20日，交通部水运司在广州组织召开港珠澳大桥通航净空尺度及技术要求专题部审会。研究单位对照交通部要求，围绕大桥建设对锚地的影响、隧道人工岛及其口门宽度布置等问题开展一系列专题论证。
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24日，广东省海洋与渔业局主持召开了中华白海豚影响专题研究报告专家评审会
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11月
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4日，国家海洋局批复了港珠澳大桥工程海域使用预审意见。
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2006年
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7月
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14日，港珠澳大桥前期工作协调小组第六次会议在广州举行，经大量调研、征求意见及协调，认为港珠澳大桥口岸设置和查验模式实行“三地三检”较为稳妥，同意港珠澳大桥采用“三地三检口岸”查验模式。决定由公规院补充开展“三地三检”口岸方案、大桥融资方案深化等相关专题研究。
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12月
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27日，国务院决定由国家发改委牵头成立“港珠澳大桥专责小组”，由中央牵头协调各方面利益，以加快港珠澳大桥的建设进展，有力推动建设项目的进一步落实。
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2007年
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1月
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9日，港珠澳大桥专责小组第一次会议在广州召开。会议明确在口岸查验采用 “三地三检”模式的原则下，建议了三地口岸的选址，同时建议了投融资的基本方案：即三地政府分别负责口岸和连接线的投资，大桥主体按照吸引企业、社会投资为基本模式。
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4月
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13日，协调小组办公室在广州主持召开了《港珠澳大桥工程海洋环境影响评价大纲》专家咨询会，形成了专家意见
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6月
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1日，港珠澳大桥前期工作协调小组第七次会议在广州召开。会议研究了大桥通航标准、启动牵头招标顾问比选工作、开展地质勘查工程等问题。
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7月
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12日、11月21日，国家渔政渔港监督管理局分别在珠海和广州主持召开了“港珠澳大桥对珠江口中华白海豚影响专题研究报告”专家评审会，形成了评审意见。
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2008年
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8月
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粤港合作联席会议第十一次会议提出，大桥海中桥隧主体工程采用“政府全额出资本金方式”；大桥主体工程资本金总额为157.3亿元，其中内地政府出资70亿元，香港出资67.5亿元，澳门出资19.8亿元；资本金以外部分由粤港澳三方共同组建的项目管理机构通过贷款来筹集。大桥建成后实行收费还贷。港、粤、澳三地政府分别负责口岸及连接线的投资。
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11月
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10日，国家渔政局批复了《港珠澳大桥工程对珠江口中华白海豚的影响专题研究报告》。
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27日，港珠澳大桥前期工作协调小组第九次会议在广州召开，会议就项目融资方案、工可上报、初步设计招标、项目组织框架达成了共识
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12月
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1日，港珠澳大桥主体工程初步设计招标工作启动
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29日，广东省发改委向国家发改委上报了《关于上报港珠澳大桥工程可行性研究报告的请示》（粤发改交[2008]1510号）。
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2009年
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2月
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12日，国家海洋局重新出具《关于港珠澳大桥工程项目用海的预审意见》，项目用海选址符合广东省海洋功能区划。
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13日，国土资源部出具《关于港珠澳大桥项目建设用地预审意见的复函》，项目符合《国家高速公路网规划》和供地政策。
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17日，水利部出具《关于港珠澳大桥水土保持方案的复函》，通过了大桥水土保持方案。
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2月—6月，中国国际工程咨询公司在珠海、北京组织专家对工程、系统和交通经济分别评估，在此基础上召开了综合组专家会，形成了专家组意见；国家发改委、交通运输部、水利部、广东省发改委、广东省交通厅、珠江水利委员会等部门以及香港、澳门的代表参加了有关专题评估会。
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交通运输部和部专家委员会在珠海市主持召开了港珠澳大桥工程可行性研究报告审查会，成立了由20位专家组成的专家组，形成了行业评估审查报告。
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3月
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5日，温家宝总理在十一届全国人大二次会议上所作的《政府工作报告》中指出“不断拓展粤港澳三地合作的深度和广度，加快推动港珠澳大桥、港深机场铁路、广深港高速铁路等基础设施建设”。
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13日，温家宝总理在回答中外记者提问时明确“港珠澳大桥融资问题已经解决，各项准备工作加紧进行，年内一定开工。
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大桥主体工程初步设计工作正式启动。经公开招标，确定由中交公路规划设计院有限公司、丹麦科威国际咨询公司、香港奥雅纳工程顾问、上海市隧道工程轨道交通设计研究院和中交第一航务工程勘察设计院有限公司组成的联合体中标。
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24日，港珠澳大桥前期工作协调小组办公室驻珠海现场指挥部挂牌。
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4月
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通过公开选聘，中国银行确定为港珠澳大桥主桥项目贷款牵头行，全额报销220亿元人民币的项目贷款。4月14日，协调小组在香港举行了港珠澳大桥主桥项目融资简介会。
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5月
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办公室组织完成了港珠澳大桥主体工程设计及施工咨询招标工作。6月9日，经协调小组授权，办公室与中标单位上海市政工程设计研究总院联合体（成员包括上海市政工程设计研究总院、林同棪国际集团、荷兰隧道工程咨询公司、广州市地下铁道设计研究院）在珠海举行了港珠澳大桥主体工程设计及施工咨询合同谈判和签约仪式。
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6月
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办公室组织完成了珠澳口岸人工岛填海工程设计招标工作。7月29日，经协调小组授权，办公室与中标单位中交第四航务工程勘察规划设计院有限公司在珠海签署了珠澳口岸人工岛填海工程设计合同谈判备忘录及合同协议书。
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8月
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11日，国家海洋局出具了《关于港珠澳大桥工程环境影响报告书核准意见的复函》，核准港珠澳大桥工程环境影响报告书。
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13日，交通运输部出具了《关于港珠澳大桥可行性研究报告的审查意见》，同意建设港珠澳大桥。
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21日，港珠澳大桥前期工作协调小组办公室整体移师珠海办公。
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9月
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30日，办公室收到了初步设计联合体提交的港珠澳大桥主体工程初步设计文件（第一版），并在当天按召集人要求提交协调小组同步开展审查工作。
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10月
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28日，国务院总理温家宝主持召开了国务院常务会议，正式批准了港珠澳大桥工程可行性研究报告。标志着港珠澳大桥前期工作已顺利完成，港珠澳大桥正式进入实施阶段。
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11月
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4日，国家发展改革委印发了《关于审批港珠澳大桥工程可行性研究报告的请示的通知》，要求在项目建设期间要加强协调，保障项目顺利实施，确保工程建设优质、安全，严格控制项目总投资
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港珠澳大桥珠澳口岸人工岛填海工程施工、施工监理招标工作顺利完成。经公开招标，中交第四航务工程局有限公司联合体（联合体成员为：中交第四航务工程局有限公司联合体、中交广州航道局有限公司）为港珠澳大桥珠澳口岸人工岛填海工程施工北标段中标人，中交第一航务工程局有限公司联合体（联合体成员为：中交第一航务工程局有限公司联合体、中交天津航道局有限公司）为港珠澳大桥珠澳口岸人工岛填海工程施工南标段中标人，广州南华工程管理有限公司为港珠澳大桥珠澳口岸人工岛填海工程施工监理中标人。
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10日，广东省交通运输厅在珠海市组织召开了《港珠澳大桥珠澳口岸人工岛填海工程施工图设计》评审会，并于11月11日印发了“港珠澳大桥珠澳口岸人工岛填海工程施工图设计审查意见”（粤交基函[2009]2078号）。
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18日，办公室收到了办公室收到了初步设计联合体提交的港珠澳大桥主体工程初步设计文件（第二版）
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20-23日，广东省交通运输厅在珠海组织召开了“主体工程初步设计预审查会”。并于11月27日印发了“港珠澳大桥主体工程初步设计预评审意见”（粤交基函[2009]2192号）。
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办公室完成保险经纪应聘文件的选聘工作，经协调小组代表评选，达信（北京）保险经纪有限公司中选。11月26日，办公室签署《港珠澳大桥主体工程项目保险经纪合同》。
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12月
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2日，水利部珠江水利委员会出具《关于港珠澳大桥珠澳口岸人工岛围填水域工程先行开工意见的函》。
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8日，办公室在珠海主持召开了港珠澳大桥珠澳口岸人工岛填海工程建设管理工作移交会议，正式完成了移交。参会单位有：珠海市人民政府、珠海格力港珠澳大桥人工岛发展有限公司、中交第四航务工程局有限公司联合体、中交第一航务工程局有限公司联合体、广州南华工程管理有限公司、中交第四航务工程勘察规划设计院有限公司。
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15日，由粤、港、澳三地政府主办，珠海市政府和港珠澳大桥前期工作协调小组办公室承办的港珠澳大桥开工仪式在珠海隆重举行，中共中央政治局常委、国务院副总理李克强在珠海出席了港珠澳大桥工程开工仪式，宣布工程开工，并与粤港澳代表、工程建设者和当地群众共同见证大桥开工的历史性时刻。中共中央政治局委员、广东省委书记汪洋出席开工仪式，国家发展改革委副主任张晓强、广东省省长黄华华、中国交通建设集团总裁孟凤朝、香港特别行政区行政长官曾荫权、澳门特别行政区行政长官何厚铧先后在开工仪式上致辞，广东省委常委、常务副省长黄龙云主持了开工仪式。候任澳门特别行政区行政长官崔世安、国家住房城乡建设部部长姜伟新、交通运输部部长李盛霖、国务院副秘书长尤权、澳门中联办主任白志健、国务院港澳办副主任周波、香港中联办副主任郭莉等亦出席了开工仪式。
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16日，港珠澳大桥专责小组第二次会议在广州召开，会议由专责小组组长、国家发展改革委副主任张晓强主持，参加会议的有港珠澳大桥专责小组全体成员，港珠澳大桥前期工作协调小组全体成员，国家发展改革委、交通运输部、国务院港澳事务办公室、粤港澳三方政府代表近50人。
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24日，办公室收到了初步设计联合体提交的港珠澳大桥主体工程初步设计文件（第三版），并于当日向广东省交通运输厅报送了《关于报送港珠澳大桥主体工程初步设计报部审文件的函》
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办公室收到总体方案深化研究阶段的电子文件终稿并进行了核查。
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2010年
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1月
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1月14日，前期工作协调小组办公室在珠海组织召开了“海中桥隧工程结构健康监测系统设计与方案研究”验收评审会。
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1月25日，前期工作协调小组办公室在广州组织召开了“耐久性评估及耐久性混凝土试验研究”验收评审会。
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2月
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2月1日，前期工作协调小组办公室组织召开了“港珠澳大桥施工及质量验收标准”编制工作大纲评审会，形成了专家评审意见。
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2月2-5日，港珠澳大桥初步设计专家审查会在珠海召开，国家发改委、交通运输部、广东省交通运输厅、香港路政署和澳门建设发展办公室等有关单位代表以及40多位资深专家出席了会议，对主体工程初步设计方案进行了审查。
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2月3日，交通运输部在珠海组织召开了“隧岛桥跨海集群工程建设关键技术研究项目建议书”专家咨询会。
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2月6日，前期工作协调小组办公室在广州组织召开了“沉管管段浮运沉放的物理模型试验研究”验收评审会。
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2月底，粤港澳三地政府签署了《港珠澳大桥建设、营运、维护及管理协议》。根据该协议，三地将通过更紧密的沟通，在友好协商并按照属地法律原则下，三地政府共同对港珠澳大桥项目的各项事务进行处理及推展，协议同时就大桥的建设、营运、维护及管理制订出三地之间的合作关系和权责。
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3月
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3月5日，国务院总理温家宝在十一届人大三次会议上作《政府工作报告》，提出“要认真实施珠江三角洲地区改革发展规划纲要，积极推进港珠澳大桥等大型跨境基础设施建设和珠海横琴岛开发，深化粤港澳合作，密切内地与港澳的经济联系。”
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3月8日，前期工作协调小组办公室在南京组织召开了《港珠澳大桥对珠江口港口、航道影响研究报告》评审会。广东省发改委等有关单位及设计、咨询联合体代表参加了会议。
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3月11 -12日，珠江水利委员会在广州组织召开了《港珠澳大桥工程防洪评价报告》评审会议。
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3月23日-24日，中华人民共和国海事局在广州主持召开了《港珠澳大桥主体工程初步设计通航安全评估专题研究报告》评审会。与会专家、代表勘察了现场，听取了前期工作协调小组办公室和中交公规院对大桥项目的介绍和报告编写单位的汇报，并形成了评审意见。
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3月31日，交通运输部印发了《关于港珠澳大桥主体工程初步设计的批复》（交公路发[2010]167号），为下阶段工程设计工作提供了重要的指导依据，同时也标志着主体工程初步设计工作取得重要的阶段性成果。
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4月
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4月11-12日，前期工作协调小组办公室在珠海组织召开了“岛隧招标技术文件及施工及质量验收标准”审查会。
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4月14日，前期工作协调小组办公室在北京组织召开了“隧道抗震性能及减震措施分析”验收评审会。
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4月15日，前期工作协调小组办公室在北京组织召开了“沉管段地基加固方案研究”验收评审会。
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4月 15日，以国家发改委副主任杜鹰为组长、国家12个部委组成的国家督促检查组考察了港珠澳大桥项目进展情况，广东省委常委、广东省常务副省长朱小丹陪同此次考察。该次考察旨在督促检查实施《珠江三角洲地区改革发展规划纲要》工作情况，作为粤港澳共建的大型跨境项目，港珠澳大桥是此次考察重点之一。前期工作协调小组办公室主任朱永灵介绍了项目进展情况。
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4月26日，前期工作协调小组办公室在广州组织召开了“基槽开挖工艺及回淤观测”验收评审会。
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4月29日，前期工作协调小组办公室在珠海组织召开了“港珠澳大桥设计指导准则”验收评审会。
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5月
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5月19日，广东省交通运输厅主持召开了港珠澳大桥岛隧工程设计施工总承包招标文件商务部分咨询会。
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5月21日，前期工作协调小组办公室在广州组织召开了“港珠澳大桥桥位持续气象观测及风参数研究”验收评审会。
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5月24日，港珠澳大桥三地联合工作委员会第一次会议在广东省珠海市召开。会议由三地联合工作委员会主任、广东省发展改革委主任李妙娟主持。会议宣布三地委成立，协调小组和三地委进行了工作交接。会议聘任现任办公室主任朱永灵先生担任港珠澳大桥管理局局长，会议亦一致通过了《港珠澳大桥管理局章程》。
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5月25日，农业部水生野生动植物保护办公室在珠海主持召开的《港珠澳大桥主体工程初步设计阶段中华白海豚保护区内施工组织方案专项论证报告》专家评审会。
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5月，国家外汇管理局批复了港珠澳大桥管理局外汇账户及其资金结汇和划转。
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6月
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6月，粤港澳三方正式签署了《港珠澳大桥管理局章程》。
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6月7日，经粤港澳三方政府授权，前期工作协调小组办公室与珠海市港珠澳大桥建设协调办公室（珠海市政府授权）、珠海格力港珠澳大桥人工岛发展有限公司正式签署了《港珠澳大桥珠澳口岸人工岛大桥管理区填海工程建设管理委托协议》。
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6月 21-22日，港珠澳大桥主体工程桥梁技术设计咨询审查会在广州召开。
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6月26日，香港特区行政长官曾荫权一行自九洲港乘船参观了港珠澳大桥连接点，珠海市委书记甘霖、副市长陈洪辉陪同了参观，前期工作协调小组办公室主任朱永灵随船介绍了大桥项目各项工作目前进展情况.
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6月 28日，农业部水生野生动植物保护办公室在北京组织专家对《港珠澳大桥主体工程初步设计阶段珠江口中华白海豚国家级自然保护区内施工方案专项论证报告》进行了评审，原则同意报告提出的“在落实各项保护与缓解措施前提下，每年4—8月份在保护区内有条件施工”的建议。
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7月
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7月8日，国家科技部在北京组织召开了“十一五”国家科技支撑计划“港珠澳大桥跨海集群工程建设关键技术研究与示范”项目可行性论证会，会议邀请了黄卫院士、王梦恕院士、陈肇元院士等14位专家、学者参会论证。国家科技部、交通运输部的相关领导和代表出席了会议。
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7月26日，管理局发布公告，对岛隧工程的施工图设计和工程施工以设计施工总承包方式进行公开招标。8月5日上午，组织各投标人进行现场踏勘，下午召开了投标预备会。10月26日，在广州建设工程交易中心举行了开标仪式，广东省纪委省监察厅、广东省交通运输厅、香港路政署、澳门建设发展办公室等派代表出席了开标仪式。10月26日下午至10月29日，在广东省交通运输厅等省政府有关部门派出的监督代表的监督下，在广州建设工程交易中心见证代表的全过程见证下，评标委员会圆满完成了评标工作。交通运输部公路局、监察局派出督察代表对评标工作进行了督察。
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7月27日，港珠澳大桥管理局（下称“管理局”）获得广东省事业单位登记管理局颁发的《事业单位法人登记证书》和广东省质量技术监督局颁发的《组织机构代码证》，正式成立。
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8月
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8月11日，管理局发布主体工程试验检测中心招标公告。9月27日至28日，完成了开评标工作。
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8月13日，港珠澳大桥三地联合工作委员会第二次会议在广州市广东大厦召开。会议审议通过管理局除局长外的高级管理人员人选，审议聘任苏建梅女士为三地委办公室主任。
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8月20日，管理局在广州组织召开了“管节变形缝的水密性、耐久性试验研究”验收评审会。
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8月30日，交通运输部在北京组织召开了“港珠澳大桥主体工程桥梁技术设计审查会”，港珠澳大桥三地联合工作委员会及其办公室的代表、广东省交通运输厅、港珠澳大桥管理局、港珠澳大桥设计及施工咨询联合体参加了会议。
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9月
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9月8日，管理局发布了主体工程岛隧工程监理招标公告。9月21日上午，管理局组织召开了招标标
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